AT2G22990.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : sinapoylglucose 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
sinapoylglucose:malate sinapoyltransferase. Catalyzes the formation of sinapoylmalate from sinapoylglucose. Mutants accumulate excess sinapoylglucose. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
sinapoylglucose 1 (SNG1); FUNCTIONS IN: sinapoylglucose-malate O-sinapoyltransferase activity, serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: phenylpropanoid metabolic process, proteolysis; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 9 (TAIR:AT2G23010.1); Has 3959 Blast hits to 3880 proteins in 457 species: Archae - 0; Bacteria - 470; Metazoa - 646; Fungi - 843; Plants - 1550; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 450 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9786393..9789925 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 49441.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 433 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLKIKFLLL LVLYHHVDSA SIVKFLPGFE GPLPFELETG YIGIGEDENV QFFYYFIKSE NNPKEDPLLI WLNGGPGCSC LGGIIFENGP VGLKFEVFNG 101: SAPSLFSTTY SWTKMANIIF LDQPVGSGFS YSKTPIDKTG DISEVKRTHE FLQKWLSRHP QYFSNPLYVV GDSYSGMIVP ALVQEISQGN YICCEPPINL 201: QGYMLGNPVT YMDFEQNFRI PYAYGMGLIS DEIYEPMKRI CNGNYYNVDP SNTQCLKLTE EYHKCTAKIN IHHILTPDCD VTNVTSPDCY YYPYHLIECW 301: ANDESVREAL HIEKGSKGKW ARCNRTIPYN HDIVSSIPYH MNNSISGYRS LIYSGDHDIA VPFLATQAWI RSLNYSPIHN WRPWMINNQI AGYTRAYSNK 401: MTFATIKGGG HTAEYRPNET FIMFQRWISG QPL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)