AT2G22970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 11 (SCPL11); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 12 (TAIR:AT2G22920.2); Has 3892 Blast hits to 3798 proteins in 426 species: Archae - 0; Bacteria - 404; Metazoa - 645; Fungi - 842; Plants - 1574; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 427 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9774875..9778224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49235.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 433 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELTLKLLVL LLFILNHHVG SGSIVKFLPG FEGPLPFELE TGYIGIGEEE EVQLFYYFIK SERNPKEDPL LLWLSGGPGC SSITGLLFQN GPLALKSEVY 101: NGSVPSLVST TYSWTKTANI IFLDQPVGAG FSYSRAPLID TPTDTGEVKR IHEFLQKWLS KHPQFSSNHF YAGGDSYSGM IVPALVQEIS KGNYICCNPP 201: INLKGYVLGN PITHEDDPNY RIPFSHGMAL ISDELYESIR EACKGNYFNV DPRNTKCLKL VEEFHKCTDK LNEFHILSPD CDTASPDCYL YPFYLISFWA 301: NDESVRDALH VNKRSIGKWE RCNYLSKPYN KDIKSSVPYH MNNSVSGYRS LIYSGDHDLV VPFLATQAWI KSLNYSIIDE WRPWMIRDQI TGYTRTYSNK 401: MTFATVKGSG HTAENKPQES FIMFRRWING QPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)