AT2G22410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : SLOW GROWTH 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
SLOW GROWTH 1 (SLO1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pentatricopeptide repeat (InterPro:IPR002885); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein (TAIR:AT2G29760.1); Has 42589 Blast hits to 14346 proteins in 282 species: Archae - 0; Bacteria - 11; Metazoa - 210; Fungi - 265; Plants - 41374; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 729 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9509035..9511080 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76718.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 681 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNISKAKLLL LPPPLTPKLN RSLYSHSQRR TRSLPHHRDK PINWNSTHSF VLHNPLLSLL EKCKLLLHLK QIQAQMIING LILDPFASSR LIAFCALSES 101: RYLDYSVKIL KGIENPNIFS WNVTIRGFSE SENPKESFLL YKQMLRHGCC ESRPDHFTYP VLFKVCADLR LSSLGHMILG HVLKLRLELV SHVHNASIHM 201: FASCGDMENA RKVFDESPVR DLVSWNCLIN GYKKIGEAEK AIYVYKLMES EGVKPDDVTM IGLVSSCSML GDLNRGKEFY EYVKENGLRM TIPLVNALMD 301: MFSKCGDIHE ARRIFDNLEK RTIVSWTTMI SGYARCGLLD VSRKLFDDME EKDVVLWNAM IGGSVQAKRG QDALALFQEM QTSNTKPDEI TMIHCLSACS 401: QLGALDVGIW IHRYIEKYSL SLNVALGTSL VDMYAKCGNI SEALSVFHGI QTRNSLTYTA IIGGLALHGD ASTAISYFNE MIDAGIAPDE ITFIGLLSAC 501: CHGGMIQTGR DYFSQMKSRF NLNPQLKHYS IMVDLLGRAG LLEEADRLME SMPMEADAAV WGALLFGCRM HGNVELGEKA AKKLLELDPS DSGIYVLLDG 601: MYGEANMWED AKRARRMMNE RGVEKIPGCS SIEVNGIVCE FIVRDKSRPE SEKIYDRLHC LGRHMRSSLS VLFSEYEITN N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)