AT2G18450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : succinate dehydrogenase 1-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Nuclear encoded mitochondrial flavoprotein subunit of succinate dehydrogenase complex . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
succinate dehydrogenase 1-2 (SDH1-2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit (InterPro:IPR011281), Fumarate reductase/succinate dehydrogenase, FAD-binding site (InterPro:IPR003952), Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like, C-terminal (InterPro:IPR015939), Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal (InterPro:IPR003953), Succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit (InterPro:IPR014006), Fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, C-terminal (InterPro:IPR004112); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: succinate dehydrogenase 1-1 (TAIR:AT5G66760.1); Has 17303 Blast hits to 17274 proteins in 2651 species: Archae - 275; Bacteria - 9814; Metazoa - 271; Fungi - 379; Plants - 135; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6429 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7997510..8000801 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 69367.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 632 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWRCLRVASS SRRSESNGAF ITSQLSRFFS APPSAGDKSS YTIVDHTYDA VVVGAGGAGL RAAIGLSEHG FNTACITKLF PTRSHTVAAQ GGINAALGNM 101: SVDDWRWHMY DTVKGSDWLG DQDAIQYMCR EAPKAVIELE NYGLPFSRTE DGKIYQRAFG GQSLEFGIGG QAYRCACAAD RTGHALLHTL YGQAMKHNTQ 201: FFVEYFALDL IMNSDGTCQG VIALNMEDGT LHRFHAGSTI LATGGYGRAY FSATSAHTCT GDGNAMVARA GLPLQDLEFV QFHPTGIYGA GCLITEGARG 301: EGGILRNSEG EKFMDRYAPT ARDLASRDVV SRSMTMEIRQ GRGAGPMKDY LYLYLNHLPP EVLKERLPGI SETAAIFAGV DVTREPIPVL PTVHYNMGGI 401: PTNYHGEVIT LRGDDPDAVV PGLMAAGEAA CASVHGANRL GANSLLDIVV FGRACANRVA EIQKPGEKLK PLEKDAGEKS IEWLDRIRNS NGSLPTSKIR 501: LNMQRVMQNN AAVFRTQETL EEGCDLIDKT WDSFGDVKVT DRSMIWNSDL IETMELENLL VNACITMHSA EARKESRGAH AREDFTKRDD ANWMKHTLGY 601: WEEGNVKLEY RPVHMKTLDD EVDTFPPKPR VY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)