AT2G18000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : TBP-associated factor 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
TBP-associated factor 14 (TAF14); INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent; LOCATED IN: nucleus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: YEATS (InterPro:IPR005033); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: YEATS family protein (TAIR:AT5G45600.1); Has 784 Blast hits to 784 proteins in 216 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 356; Fungi - 265; Plants - 64; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 97 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7829035..7830059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22865.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 202 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESDIEILSE ADASMRKLRI FGIDDREDEN GRRRIKDVEV YVPIVCGSIA FYLGKKATEY RTHKWTVYVR GATNEDLGVV IKRVIFHLHP SFNNPTRVVD 101: APPFALSECG WGEFKIDITV FFHTDVCEKK LELSHVLKLN PENAYGPIPK SIKIPVVAES YNEVVFPDPF ESFVARVHNH PAIQISNIPD GLNLPPPGAF 201: LF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)