AT2G16700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : actin depolymerizing factor 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes actin depolymerizing factor 5 (ADF5). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
actin depolymerizing factor 5 (ADF5); FUNCTIONS IN: actin binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Actin-binding, cofilin/tropomyosin type (InterPro:IPR002108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: actin depolymerizing factor 9 (TAIR:AT4G34970.1); Has 1273 Blast hits to 1272 proteins in 262 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 475; Fungi - 143; Plants - 513; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 139 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7244717..7245467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16468.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 143 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMAFKMATT GMRVTDECTS SFMDMKWKKV HRYIVFKIEE KSRKVTVDKV GGAGESYHDL EDSLPVDDCR YAVFDFDFVT VDNCRKSKIF FIAWSPEASK 101: IRAKILYATS KDGLRRVLEG IHYELQATDP TEMGFDIIQD RAK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)