AT2G03800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : D-aminoacyl-tRNA deacylases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a D-aminoacyl-tRNA deacylase. Involved in detoxification of D-aminoacyl-tRNA. Mutants also show ethanol-hypersensitive phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GEKO1 (GEK1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Uncharacterised conserved protein UCP016210 (InterPro:IPR018033), D-aminoacyl-tRNA deacylase (InterPro:IPR007508); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:1156782..1158695 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34733.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVTLIVATTA DPASINPAAA LLAMPGWTAG PILPPDIKSF SNKQTRVIQH DRSIVKEDDL DLRWEEATGE VVDEVIFLSR HTAVSNRPAL TVHPIGVLHL 101: KDGESPPQGG KPGWAALPST RIGPWFRLLK KMAEAHGLVP EFEITLEATH HGPITNKPTM FLEIGSTEEY WKRQDAAQVM ALLMWEGLGL GGSEEVGKWK 201: SETGKRKVLL GIGGGHYAPR HMDIALKDDI WVGHLLSGYS LPMEDPTQTK TTPGENYIGG NWRQSIKAAF EATKASFPGG EILAHLDHKS FKGWQKKAIT 301: EFLAEESINV GKPNDFT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)