AT2G03690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : coenzyme Q biosynthesis Coq4 family protein / ubiquinone biosynthesis Coq4 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
coenzyme Q biosynthesis Coq4 family protein / ubiquinone biosynthesis Coq4 family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: ubiquinone biosynthetic process; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Coenzyme Q biosynthesis Coq4 (InterPro:IPR007715); Has 675 Blast hits to 675 proteins in 251 species: Archae - 0; Bacteria - 141; Metazoa - 162; Fungi - 176; Plants - 60; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 136 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:1122122..1123011 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25880.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 226 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIIERARVPL SRWQQAAVAM GSALGALVDP RRADLIAALG ETTGKPAFEM VLERMKKSEE GRAILLERPR VVSEQVGHAW DLPENTFGAA YAKFMGSRNF 101: SPDDRPPVRF METDELAYVA TRAREVHDLW HTLFGLPTNL IGESSLKVIE FEQMYLPMCM LSVIGGTVRF NEKQRSMFLK HYLPWAVRAG RQCTDLMCVY 201: YERHFSEDLE QVRRKWGIIP APQHPK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)