AT4G29530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.738 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyridoxal phosphate phosphatase-related protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pyridoxal phosphate phosphatase-related protein; FUNCTIONS IN: phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate phosphatase, PHOSPHO2 (InterPro:IPR016965), HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB, PSPase-like (InterPro:IPR006383), Pyridoxal phosphate phosphatase-related (InterPro:IPR006384); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyridoxal phosphate phosphatase-related protein (TAIR:AT1G17710.1); Has 373 Blast hits to 361 proteins in 111 species: Archae - 0; Bacteria - 31; Metazoa - 175; Fungi - 16; Plants - 106; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 45 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14496164..14497310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28054.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 245 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAKIVILFDF DRTLIDGDSD NWVVTEMGLT EIFHQLRFTL PWNRLMDRMM MELQSQGRSI DDIKSCLKKM PIDSHIIEAI KSAKSSGCDL KIVSDANQFF 101: IEKILEHHDL VDCFSEIYTN PTSLDDNGNL RILPYHSDAL PPHSCNLCPS NLCKGLVMDH LRASSSNDQI PRRFIYLGDG GGDFCPTLKL RECDFVMPRT 201: NYPLWKKISD NPLLIKAEVK EWSSAEEQQR ILLQLVSTIT KEEDS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)