AT2G03520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.860 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ureide permease 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AtUPS4, a member of the Arabidopsis ureide permease family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ureide permease 4 (UPS4); LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: stigma, seedling, fruit, filament, seed; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ureide permease 1 (TAIR:AT2G03590.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:1069494..1071269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43205.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 401 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYVVESKAGA IGCMILSLCC LGSWPAILTL LERRGRLPQH TFLDFATANL LAAIVIAFSL GEIGKSTFLK PDFTTQLPQD NWPSVLLAVA GGVLLSIGNL 101: ATQYAFAFVG LSVTEVITAS ITVVIGTTLN YFLDNKINKA EILFPGVGCF LIAVFLGAAV HASNAADVKE KLKSLPSEDL YSSIENGEDK PEIEKTDVES 201: QEKLAEKAKA GTAGFYVELE NKRAIKVFGK SIMIGLFITL FAGISLSLFS PAFNLATNDQ WSTLPKGVPK LVVYTAFFYF SIAGFLISLI LNLIFLYRPM 301: VGLARSSLKK YIYDSKGRGW AVFAGFLCGF GNGLQFMGGQ AAGYAAADSV QALPLVSTFW GIVLFGEYRK SSKRTYALLV SMLAMFVAAV AILMASSGHR 401: K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)