AT2G02800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.797 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : protein kinase 2B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes protein kinase APK2b. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
protein kinase 2B (APK2B); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: nucleus, plasma membrane, cytoplasm; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: protein kinase 2A (TAIR:AT1G14370.1); Has 113663 Blast hits to 112197 proteins in 3955 species: Archae - 101; Bacteria - 13127; Metazoa - 42007; Fungi - 9244; Plants - 32902; Viruses - 370; Other Eukaryotes - 15912 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:796889..799250 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46291.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 426 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNCLDSSAK VDSSSHSPHA NSASLSSRVS SKTSRSTVPS SLSINSYSSV ESLPTPRTEG EILSSPNLKA FTFNELKNAT RNFRPDSLLG EGGFGYVFKG 101: WIDGTTLTAS KPGSGIVVAV KKLKTEGYQG HKEWLTEVNY LGQLSHPNLV KLVGYCVEGE NRLLVYEFMP KGSLENHLFR RGAQPLTWAI RMKVAIGAAK 201: GLTFLHDAKS QVIYRDFKAA NILLDAEFNS KLSDFGLAKA GPTGDKTHVS TQVMGTHGYA APEYVATGRL TAKSDVYSFG VVLLELLSGR RAVDKSKVGM 301: EQSLVDWATP YLGDKRKLFR IMDTRLGGQY PQKGAYTAAS LALQCLNPDA KLRPKMSEVL AKLDQLESTK PGTGVGNRQA QIDSPRGSNG SIVQKSPRRY 401: SYDRPLLHIT PGASPLPTHN HSPRVR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)