AT1G76090.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.983 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : sterol methyltransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferase, an enzyme in the sterol biosynthetic pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
sterol methyltransferase 3 (SMT3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sterol methyltransferase C-terminal (InterPro:IPR013705), Methyltransferase type 11 (InterPro:IPR013216); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sterol methyltransferase 2 (TAIR:AT1G20330.1); Has 10191 Blast hits to 10184 proteins in 2043 species: Archae - 312; Bacteria - 6392; Metazoa - 125; Fungi - 424; Plants - 648; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2290 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28550592..28551671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 40126.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 8.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 359 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSVALYCTA GLIAGAVYWF ICVLGPAERK GKRASDLSGG SISAEKVKDN YNQYWSFFRK PKEIESAEKV PDFVDTFYNL VTDIYEWGWG QSFHFSPHVP 101: GKSDKDATRI HEEMAVDLIK VKPGQKILDA GCGVGGPMRA IAAHSKAQVT GITINEYQVQ RAKLHNKKAG LDSLCNVVCG NFLKMPFDEN TFDGAYSIEA 201: TCHAPKLEEV YSEIFRVMKP GSLFVSYEWV TTEKYRDDDE EHKDVIQGIE RGDALPGLRS YADIAVTAKK VGFEVVKEKD LAKPPSKPWW NRLKMGRIAY 301: WRNHVVVVIL SAIGVAPKGT VDVHKMLFKT ADYLTRGGET GIFSPMHMIL CRKPEKASE |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)