AT1G73980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphoribulokinase / Uridine kinase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphoribulokinase / Uridine kinase family; FUNCTIONS IN: adenylate cyclase activity, phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: biosynthetic process, cAMP biosynthetic process, metabolic process; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribulokinase/uridine kinase (InterPro:IPR006083), Uridine kinase (InterPro:IPR000764), Adenylate cyclase (InterPro:IPR008172); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoribulokinase / Uridine kinase family (TAIR:AT1G26190.1); Has 4488 Blast hits to 4465 proteins in 1702 species: Archae - 37; Bacteria - 3307; Metazoa - 347; Fungi - 118; Plants - 328; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 349 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27820292..27823527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72412.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 643 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALDSSVALS PRRRHGLLRD QVQLIKRKDS GRYEIVPIED PLSFEKGFYA VIRACQLLAQ KNDGLILVGL AGPSGAGKTI FTEKILNFMP SIAIINMDNY 101: NDGTRVIDGN FDDPRLTDYD TLLDNIHGLR DGKPVQVPIY DFKSSSRIGY RTLEVPSSRI VILEGIYALS EKLRPLLDLR VSVTGGVHFD LVKRVLRDIQ 201: RAGQEPEEII HQISETVYPM YKAFIEPDLK TAQIKILNKF NPFSGFQNPT YILKSSKAVT PEQMKAALSE DFKERTEETY DIYLLPPGED PEACQSYLRM 301: RNRDGKYNLM FEEWVTDRPF IISPRITFEV SVRLLGGLMA LGYTIATILK RKSHIFDDDK VIVKTDWLEQ LNRTYVQVQG KDRTFVKNVA DQLGLEGSYV 401: PHTYIEQIQL ERLVNDVLAL PDDLKTKLSL DDDTVSSPKE ALSRASVDSR MKYLHGGVSK SYTNPRHKVL PNLTRLAVNN RMLDARAPAS PATLPNQGFI 501: TQLSDQISTL NERMDEFTSR IEELNSKIPN RIAPSGSQHN LALPIENGNG SVLSFSASAS QLVRESPLME EVVLVARGQR QIMHQMDTLS NLLREYVGEK 601: TRIERLDSSR TNSTTQNLES STVPILLGLA IGCVGIFAYS RLK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)