AT1G64600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methyltransferases;copper ion binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
methyltransferases;copper ion binding; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity, copper ion binding; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein Rsm22, bacterial-type (InterPro:IPR015324), Cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11 (InterPro:IPR007533); Has 735 Blast hits to 687 proteins in 272 species: Archae - 0; Bacteria - 212; Metazoa - 195; Fungi - 160; Plants - 44; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 124 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:23995996..23998625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61793.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 537 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANAQKVFTV ETLRSASKQC LRCLVVPVRL RRAIKKYLRE EDDPHIRKKV RQLSESFQEI KDTNLQLPET TAKSLADSMN SLETKRWKIQ TVYGDSGLQY 101: RDGETAAYIA SRMPAVFSVC YRVLIEIRRR VPGFTPTRVL DFGAGTGSGF WAVKEVWPKS VEKVNIVEPS QSMQRAGRNL IQGLKDLPLI HGYTSLLALN 201: KEINKKSERK HDLVIASYVL GEIPSLKDRI TVVRQLWDLT DDLLVLVEPG TPHGANIISQ MRSHILWMEK RKLRKLEKKM KKDGKEVLDL KSGAHIVAPC 301: PHDGKCPLEN TGKYCHFVQR LQRTSSQRSY KRTKGVPLRG FEDEKFCFVA FRRGQRPREL WPLDGMKLET LKERRANKKP EDLEIDYEDF IKSQVVEVPY 401: IDPRAYDSDT MDENEEEQED GGGTDEDEED KIEEEIEEES ERASVGGGWG RIIFPPFRKG KQVTLDMCVP TKEDGSEGAF ERRVITKSKN PDLHLQAKKS 501: FWGDLWPLTT QQENGKKKQV DAEWCRPDED QKWSGWP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)