AT1G60470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.995 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galactinol synthase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
galactinol synthase 4 (GolS4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galactinol synthase 7 (TAIR:AT1G60450.1); Has 1247 Blast hits to 1246 proteins in 290 species: Archae - 0; Bacteria - 113; Metazoa - 260; Fungi - 270; Plants - 469; Viruses - 69; Other Eukaryotes - 66 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22279181..22280454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38513.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 334 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPEISVNPM YLSEKAHQAP PRRAYVTFLA GNGDYVKGVV GLAKGLRKVK SAYPLVVAML PDVPEEHREI LRSQGCVVRE IEPVYPPDNQ VEFAMAYYVL 101: NYSKLRIWNF EEYSKMIYLD ADIQVFDNID HLFDLSDAYF YAVMDCFCEK TWSHSLQYSI GYCQQCPEKV TWPEDMESPP PPLYFNAGMF VFEPSPLTYE 201: SLLQTLEITP PSPFAEQDFL NMFFEKVYKP IPLVYNLVLA MLWRHPENVE LEKVKVVHYC AAGSKPWRYT GEEANMDRED IKMLVDKWWD VYNDESLDFK 301: SKIPADAEET VTKSSILASV LEPEMTYFPA PSAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)