AT1G49050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.905 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Eukaryotic aspartyl protease family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Eukaryotic aspartyl protease family protein; FUNCTIONS IN: aspartic-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase aspartic (InterPro:IPR021109), Peptidase aspartic, catalytic (InterPro:IPR009007), Peptidase A1 (InterPro:IPR001461), Peptidase aspartic, active site (InterPro:IPR001969); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Eukaryotic aspartyl protease family protein (TAIR:AT1G77480.1); Has 2436 Blast hits to 2429 proteins in 193 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 552; Fungi - 119; Plants - 1682; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 83 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:18150638..18153186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65352.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 583 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEPDLHDQQQ QQRVHSVVII TLPPSDDPSQ GKTISAFTLT DHDYPLEIPP EDNPNPSFQP DPLHRNQQSR LLFSDLSMNS PRLVLGLLGI SLLAVAFYAS 101: VFPNSVQMFR VSPDERNRDD DDNLRETASF VFPVYHKLRA REFHERILEE DLGLENENFV ESMDLELVNP VKVNDVLSTS AGSIDSSTTI FPVGGNVYPD 201: GLYYTRILVG KPEDGQYYHL DIDTGSELTW IQCDAPCTSC AKGANQLYKP RKDNLVRSSE AFCVEVQRNQ LTEHCENCHQ CDYEIEYADH SYSMGVLTKD 301: KFHLKLHNGS LAESDIVFGC GYDQQGLLLN TLLKTDGILG LSRAKISLPS QLASRGIISN VVGHCLASDL NGEGYIFMGS DLVPSHGMTW VPMLHDSRLD 401: AYQMQVTKMS YGQGMLSLDG ENGRVGKVLF DTGSSYTYFP NQAYSQLVTS LQEVSGLELT RDDSDETLPI CWRAKTNFPF SSLSDVKKFF RPITLQIGSK 501: WLIISRKLLI QPEDYLIISN KGNVCLGILD GSSVHDGSTI ILGDISMRGH LIVYDNVKRR IGWMKSDCVR PREIDHNVPF FQG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)