AT1G27450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenine phosphoribosyl transferase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Adenosine phosphoribosyl transferase(E.C:2.4.2.7), involved in the one-step salvage of adenine to AMP. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
adenine phosphoribosyl transferase 1 (APT1); FUNCTIONS IN: adenine phosphoribosyltransferase activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, adenine salvage; LOCATED IN: cytosol, chloroplast, plasma membrane, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenine phosphoribosyl transferase (InterPro:IPR005764), Phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR000836); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: adenine phosphoribosyl transferase 3 (TAIR:AT4G22570.1); Has 9277 Blast hits to 9277 proteins in 2485 species: Archae - 216; Bacteria - 6424; Metazoa - 180; Fungi - 181; Plants - 165; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2111 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9532042..9533807 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26397.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 243 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQTIIISPLV SHRLCLARAV PCNRLLNNHH RAPPSIRLSN HRSTTSLRLF SSAAASRDSE MATEDVQDPR IAKIASSIRV IPDFPKPGIM FQDITTLLLD 101: TEAFKDTIAL FVDRYKDKGI SVVAGVEARG FIFGPPIALA IGAKFVPMRK PKKLPGKVIS EEYSLEYGTD TIEMHVGAVE PGERAIIIDD LIATGGTLAA 201: AIRLLERVGV KIVECACVIE LPELKGKEKL GETSLFVLVK SAA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)