AT1G24520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of Brassica campestris pollen protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Male fertility gene acting on tapetum and microspore | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homolog of Brassica campestris pollen protein 1 (BCP1); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Anther-specific protein agp1-like (TAIR:AT3G26110.1); Has 67 Blast hits to 55 proteins in 12 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 42; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 19 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8688699..8689058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11336.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 3.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 119 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRQNIVVVV ALVFMAIIGL AAAASSPSPS ASPSKAPAAS KTDHVEAPVT DDQIGTTDDD AAPTPGDGDV AVAGPLGSDS SYDNAPTGSA DSAKSGAAAL 101: GVSAVVVGVT SIAGSFLLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)