AT1G23440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like; FUNCTIONS IN: peptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I (InterPro:IPR000816), Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like (InterPro:IPR016125); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like (TAIR:AT1G56700.2); Has 1716 Blast hits to 1713 proteins in 745 species: Archae - 108; Bacteria - 1355; Metazoa - 46; Fungi - 19; Plants - 100; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 88 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8321940..8324019 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23619.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 217 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSEGPKAIT IHVTGFKKFL GVSENPTEKI ANGLKSYVEK RGLPSGLCLG SCSVLDTAGE GAKSKLYEVL ESSVVSGDKN NNGTVVWLHL GVNSGATKFA 101: IERQAVNEAH FRCPDELGWQ PQRLPIVVED GGISKAKETS CSTESIFQLL KKKGFEVVQS DDAGRFVCNY VYYHSLRFAE QKGHKSLFVH VPLFSKIDED 201: TQMQFVASLL EAIAATC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)