AT2G02390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.984 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione S-transferase zeta 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutathione transferase belonging to the zeta class of GSTs. Naming convention according to Wagner et al. (2002). The protein undergoes spontaneous thiolation following treatment with the oxidant tert-butylhydroperoxide. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione S-transferase zeta 1 (GSTZ1); FUNCTIONS IN: glutathione transferase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: toxin catabolic process; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Maleylacetoacetate isomerase (InterPro:IPR005955), Glutathione S-transferase, C-terminal (InterPro:IPR004046), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione S-transferase (class zeta) 2 (TAIR:AT2G02380.1); Has 17196 Blast hits to 17170 proteins in 1512 species: Archae - 0; Bacteria - 9185; Metazoa - 2216; Fungi - 532; Plants - 2070; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3193 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:629015..630955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24888.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 221 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANSGEEKLK LYSYWRSSCA HRVRIALALK GLDYEYIPVN LLKGDQFDSD FKKINPMGTV PALVDGDVVI NDSFAIIMYL DEKYPEPPLL PRDLHKRAVN 101: YQAMSIVLSG IQPHQNLAVI RYIEEKINVE EKTAWVNNAI TKGFTALEKL LVNCAGKHAT GDEIYLADLF LAPQIHGAIN RFQINMEPYP TLAKCYESYN 201: ELPAFQNALP EKQPDAPSST I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)