AT1G18690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyl transferase GMA12/MNN10 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Galactosyl transferase GMA12/MNN10 family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, transferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: integral to membrane; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Galactosyl transferase (InterPro:IPR008630); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: xyloglucan xylosyltransferase 5 (TAIR:AT1G74380.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6435153..6436694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58316.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 513 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFQDGSRSSG SGRGLSTTAV SNGGWRTRGF LRGWQIQNTL FNNIKFMILC CFVTILILLG TIRVGNLGSS NADSVNQSFI KETIPILAEI PSDSHSTDLA 101: EPPKADVSPN ATYTLEPRIA EIPSDVHSTD LVELPKADIS PNATYTLGPR IAEIPSDSHL TDLLEPPKAD ISPNATYTLG PKITNWDSQR KVWLNQNPEF 201: PNIVNGKARI LLLTGSSPGP CDKPIGNYYL LKAVKNKIDY CRLHGIEIVY NMANLDEELS GYWTKLPMIR TLMLSHPEVE WIWWMDSDAL FTDILFEIPL 301: PRYENHNLVI HGYPDLLFNQ KSWVALNTGI FLLRNCQWSL DLLDAWAPMG PKGKIRDETG KILTAYLKGR PAFEADDQSA LIYLLLSQKE KWIEKVYVEN 401: QYYLHGFWEG LVDRYEEMIE KYHPGLGDER WPFVTHFVGC KPCGSYADYA VDRCFKSMER AFNFADNQVL KLYGFSHRGL LSPKIKRIRN ETVSPLESVD 501: KFDIRRMHME TKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)