AT1G17650.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glyoxylate reductase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Glyoxylate reductase located in chloroplasts. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glyoxylate reductase 2 (GLYR2); FUNCTIONS IN: phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating) activity, glyoxylate reductase (NADP) activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, pentose-phosphate shunt, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR006115), Dehydrogenase, multihelical (InterPro:IPR013328), 6-phosphogluconate dehydrogenase, C-terminal-like (InterPro:IPR008927), 3-hydroxyacid dehydrogenase/reductase (InterPro:IPR015815), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glyoxylate reductase 1 (TAIR:AT3G25530.1); Has 16115 Blast hits to 16085 proteins in 2099 species: Archae - 147; Bacteria - 9815; Metazoa - 317; Fungi - 434; Plants - 311; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 5090 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6069594..6071964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37783.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 358 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPLVSLSFAS SSSKAMALCS ICPRIPLRFR PKPISPFLSK PQICLAYRVY SSLQSTTPST RDELGTVSIG FLGMGIMGSP MAQNLIKAGC DVTVWNRTKS 101: KCDPLVGLGA KYKSSPEEVT ATCDLTFAML ADPESAIDVA CGKNGAIFGI SSGKGYVDVS TVDVASSILI SKQIKDTGAL FLEAPVSGSK KPAEDGQLIF 201: LTAGDKPLYE KAAPFLDIMG KSKFYLGEVG NGAAMKLVVN MIMGSMMASF AEGILLSQKV GLDPNVLVEV VSQGAINAPM YSLKGPSMIK SVYPTAFPLK 301: HQQKDMRLAL GLAESVSQST PIAAAANELY KVAKSYGLSD EDFSAVIEAL KAAKSREA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)