AT1G15220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome c biogenesis protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with oxidoreductase activity present in the inner membrane of mitochondria. CCMH is postulated to play a central role in mitochondrial cytochrome c maturation, probably as part of a heme lyase complex that also holds activity of reducing apocytochrome c. CCMH interacts with apocytochrome AtCYTc-a and is shown to be present in a 500 kDa-complex along with CcmFN2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CCMH; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome C biogenesis protein CcmH (InterPro:IPR005616); Has 3193 Blast hits to 3193 proteins in 721 species: Archae - 0; Bacteria - 1884; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 31; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1278 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:5240471..5241117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17885.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 159 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKTDEERKK AQMLDARARN ISHNVRCTEC GSQSIEDSQA DIAILLRQLI RNEIGAGKTD KEIYSKLEDE FGETVLYAPK FDLQTAALWL TPVIIAGGTA 101: AGIVYQKHRL RKNVDIMALN LIRGVPLTPK ERVTILDVLI PPSPPPQGVV SRLRRWLNR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)