AT1G12640.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.999 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein; FUNCTIONS IN: acyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membrane bound O-acyl transferase, MBOAT (InterPro:IPR004299); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MBOAT (membrane bound O-acyl transferase) family protein (TAIR:AT1G63050.1); Has 1204 Blast hits to 1199 proteins in 313 species: Archae - 0; Bacteria - 269; Metazoa - 625; Fungi - 142; Plants - 47; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 121 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4303586..4305666 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52155.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 462 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDMSSMAGSI GVSVAVLRFL LCFVATIPVS FACRIVPSRL GKHLYAAASG AFLSYLSFGF SSNLHFLVPM TIGYASMAIY RPKCGIITFF LGFAYLIGCH 101: VFYMSGDAWK EGGIDSTGAL MVLTLKVISC SMNYNDGMLK EEGLREAQKK NRLIQMPSLI EYFGYCLCCG SHFAGPVYEM KDYLEWTEGK GIWDTTEKRK 201: KPSPYGATIR AILQAAICMA LYLYLVPQYP LTRFTEPVYQ EWGFLRKFSY QYMAGFTARW KYYFIWSISE ASIIISGLGF SGWTDDASPK PKWDRAKNVD 301: ILGVELAKSA VQIPLVWNIQ VSTWLRHYVY ERLVQNGKKA GFFQLLATQT VSAVWHGLYP GYMMFFVQSA LMIAGSRVIY RWQQAISPKM AMLRNIMVFI 401: NFLYTVLVLN YSAVGFMVLS LHETLTAYGS VYYIGTIIPV GLILLSYVVP AKPSRPKPRK EE |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)