AT1G07450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.738 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, binding, catalytic activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, metabolic process; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site (InterPro:IPR020904), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Glucose/ribitol dehydrogenase (InterPro:IPR002347), Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (InterPro:IPR002198); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: tropinone reductase (TAIR:AT2G29330.1); Has 110061 Blast hits to 109928 proteins in 3503 species: Archae - 928; Bacteria - 73032; Metazoa - 4466; Fungi - 5399; Plants - 2523; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 23711 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2288038..2289256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27897.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 260 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDINRWSLQG MTALVTGGSK GIGYAIVEEL VGFGARVHIC DIDETLLNEC LSGWHAKGFE VSGSICDVSS RPQRVQLMQT VSSLFGAKLN ILINNVGKYI 101: LKPTLESTAE DFSSLMATNL ESAYYISQLA HPLLKASGNG NIVFISSVTG VVSGTSTIYG VTKGALNQLA RDLACEWASD NIRANSVAPW VTATSLVQKY 201: LEDEIFAEAM FSRTPLGRAC EPREVASLVT FLCLPAASYI TGQTICIDGG FTVNGFSYKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)