AT5G28770.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : bZIP transcription factor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
bZIP protein BZO2H3 mRNA, partial cds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BZO2H3; FUNCTIONS IN: DNA binding, protein heterodimerization activity, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616), Basic leucine-zipper, C-terminal (InterPro:IPR020983); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: basic leucine zipper 25 (TAIR:AT3G54620.1); Has 2611 Blast hits to 2603 proteins in 192 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 222; Fungi - 116; Plants - 2181; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 92 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:10796648..10798147 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34313.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 314 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKVFSDEEI SGNHHWSVNG MTSLNRSASE WAFNRFIQES SAAADDGEST TACGVSVSSP PNVPVDSEEY RAFLKSKLNL ACAAVAMKRG TFIKPQDTSG 101: RSDNGGANES EQASLASSKA TPMMSSAITS GSELSGDEEE ADGETNMNPT NVKRVKRMLS NRESARRSRR RKQAHLSELE TQVSQLRVEN SKLMKGLTDV 201: TQTFNDASVE NRVLKANIET LRAKVKMAEE TVKRLTGFNP MFHNMPQIVS TVSLPSETSN SPDTTSSQVT TPEIISSGNK GKALIGCKMN RTASMRRVES 301: LEHLQKRIRS VGDQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)