AT4G31870.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione peroxidase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutathione peroxidase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione peroxidase 7 (GPX7); FUNCTIONS IN: glutathione peroxidase activity; INVOLVED IN: response to karrikin; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Glutathione peroxidase (InterPro:IPR000889); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione peroxidase 1 (TAIR:AT2G25080.1); Has 8041 Blast hits to 8040 proteins in 1748 species: Archae - 4; Bacteria - 4124; Metazoa - 797; Fungi - 210; Plants - 405; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 2493 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15410205..15411617 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25775.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 233 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFSYASFST PFNGFAANPS PITSAFLGPS LRFSTRTSKT RNPSNGVSVK SSNSHRFLVK SKNFSVYARA AAEKSVHDFT VKDIDGNDVS LDKFKGKPLL 101: IVNVASRCGL TSSNYSELSQ LYEKYKNQGF EILAFPCNQF GGQEPGSNPE IKQFACTRFK AEFPIFDKVD VNGPSTAPIY KFLKSNAGGF LGDIIKWNFE 201: KFLVDKKGKV VERYPPTTSP FQIEKDIQKL LAA |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)