AT3G52880.2
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.522 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : monodehydroascorbate reductase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a peroxisomal monodehydroascorbate reductase, involved in the ascorbate-glutathione cycle which removes toxic H2O2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
monodehydroascorbate reductase 1 (MDAR1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II (InterPro:IPR000103), FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), FAD/NAD-linked reductase, dimerisation (InterPro:IPR016156), Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, NAD-binding region (InterPro:IPR001327); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein (TAIR:AT5G03630.1); Has 30852 Blast hits to 30793 proteins in 3038 species: Archae - 685; Bacteria - 24210; Metazoa - 865; Fungi - 584; Plants - 707; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3801 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19601477..19604366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50162.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 466 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEKSFKYII LGGGVSASIL KTSDSVLVLL LLLSVRKVYL CKITCRWLIG YAAKEFANQG VQPGELAVIS KEAVAPYERP ALSKGYLFPE GAARLPGFHC 101: CVGSGGEKLL PESYKQKGIE LILSTEIVKA DLSAKSLVSA TGDVFKYQTL IIATGSTVLR LTDFGVKGAD SKNILYLREI DDADKLVEAI KAKKGGKAVV 201: VGGGYIGLEL SAVLRINNLD VTMVFPEPWC MPRLFTADIA AFYETYYTNK GVKIIKGTVA SGFTAQPNGE VKEVQLKDGR TLEADIVIVG VGAKPLTSLF 301: KGQVEEDKGG IKTDAFFKTS VPDVYAVGDV ATFPLKMYGD VRRVEHVDHS RKSAEQAVKA IKAAEGGAAV EEYDYLPFFY SRSFDLSWQF YGDNVGDSVL 401: FGDSNPSNPK PRFGAYWVQG GKVVGAFMEG GSGDENKALA KVAKARPSAE SLDELVKQGI SFAAKI |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)