AT2G33740.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.988 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nitrogen regulatory PII-like, alpha/beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a copper binding protein that forms tetramers in vitro. Gene is expressed in all tissues examined and protein is localized to the chloroplast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CUTA; FUNCTIONS IN: copper ion binding; INVOLVED IN: response to metal ion; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Divalent ion tolerance protein, CutA1 (InterPro:IPR004323), Nitrogen regulatory PII-like, alpha/beta (InterPro:IPR011322); Has 2474 Blast hits to 2474 proteins in 915 species: Archae - 144; Bacteria - 1534; Metazoa - 199; Fungi - 5; Plants - 49; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 543 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14269590..14271523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19771.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 182 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSLTTRLS AVIGSRRSFP IVGAFCVLST LSISSLSSSS PFKSGCAQSF SVVPLLRSKF SSKAFSSSIR MEESSKTVPS IVVYVTVPNR EAGKKLANSI 101: VQEKLAACVN IVPGIESVYE WEGKVQSDSE ELLIIKTRQS LLEPLTEHVN ANHEYDVPEV IALPITGGSD KYLEWLKNST RN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)