AT2G32700.7
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : LEUNIG_homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a WD40 repeat and LUFS domain containing protein that is similar to LUG. Interacts physically with SEUSS and likely functions as part of a repressor complex that represses AG. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
LEUNIG_homolog (LUH); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: flower development, negative regulation of transcription, embryo development; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: LisH dimerisation motif, subgroup (InterPro:IPR013720), WD40 repeat 2 (InterPro:IPR019782), WD40 repeat, conserved site (InterPro:IPR019775), WD40 repeat (InterPro:IPR001680), G-protein beta WD-40 repeat, region (InterPro:IPR020472), WD40 repeat-like-containing domain (InterPro:IPR011046), WD40-repeat-containing domain (InterPro:IPR017986), WD40/YVTN repeat-like-containing domain (InterPro:IPR015943), LisH dimerisation motif (InterPro:IPR006594), WD40 repeat, subgroup (InterPro:IPR019781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: LisH dimerisation motif;WD40/YVTN repeat-like-containing domain (TAIR:AT4G32551.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13867235..13871844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 87709.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 806 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQSNWEADK MLDVYIYDYL VKKKLHNTAK SFMTEGKVSP DPVAIDAPGG FLFEWWSVFW DIFIARTNEK HSEAAAAYIE AQQGKAKEQQ MQIQQLQMMR 101: QAQMQRRDPN HPSLGGPMNA IGSEGMIGQS NASALAAKMY EERMKQPNPM NSETSQPHLD ARMALLKSAT NHHGQIVQGN HQGGVSAALQ QIQSRTQQPT 201: EIKTEVNLGT SPRQLPVDPS TVYGQGILQS KPGMGSAGKY INVLHCRVIA HRKENGGLNP GVSGLPLKGW PLTGIEQMRP GLGGPQVQKS FLQNQSQFQL 301: SPQQQQHQML AQVQAQGNMT NSPMYGGDMD PRRFTGLPRG NLNPKDGQQN ANDGSIGSPM QSSSSKHISM PPVQQSSSQQ QDHLLSQQSQ QNNRKRKGPS 401: SSGPANSTGT GNTVGPSNSQ PSTPSTHTPV DGVAIAGNMH HVNSMPKGPM MYGSDGIGGL ASSANQLLQD DMDQFGDVGA LEDNVESFLS QDDGDGGSLF 501: GTLKRNSSVH TETSKPFSFN EVSCIRKSAS KVICCSFSYD GKLLASAGHD KKVFIWNMET LQVESTPEEH AHIITDVRFR PNSTQLATSS FDKTIKIWDA 601: SDPGYFLRTI SGHAAPVMSI DFHPKKTELL CSCDSNNDIR FWDINASCVR AVKGASTQVR FQPRTGQFLA AASENTVSIF DIENNNKRVN IFKGHSSNVH 701: SVCWSPNGEL VASVSEDAVK LWSLSSGDCI HELSNSGNKF HSVVFHPSYP DLLVIGGYQA IELWNTMENK CMTVAGHECV ISALAQSPST GVVASASHDK 801: SVKIWK |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)