AT2G32700.6
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : LEUNIG_homolog | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a WD40 repeat and LUFS domain containing protein that is similar to LUG. Interacts physically with SEUSS and likely functions as part of a repressor complex that represses AG. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
LEUNIG_homolog (LUH); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: flower development, negative regulation of transcription, embryo development; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WD40 repeat 2 (InterPro:IPR019782), LisH dimerisation motif, subgroup (InterPro:IPR013720), WD40 repeat, conserved site (InterPro:IPR019775), WD40 repeat (InterPro:IPR001680), G-protein beta WD-40 repeat, region (InterPro:IPR020472), WD40 repeat-like-containing domain (InterPro:IPR011046), WD40-repeat-containing domain (InterPro:IPR017986), WD40/YVTN repeat-like-containing domain (InterPro:IPR015943), LisH dimerisation motif (InterPro:IPR006594), WD40 repeat, subgroup (InterPro:IPR019781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: LisH dimerisation motif;WD40/YVTN repeat-like-containing domain (TAIR:AT4G32551.1); Has 67484 Blast hits to 31766 proteins in 819 species: Archae - 68; Bacteria - 8700; Metazoa - 26198; Fungi - 15367; Plants - 8354; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 8797 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13867235..13871844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85278.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 785 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQSNWEADK MLDVYIYDYL VKKKLHNTAK SFMTEGKVSP DPVAIDAPGG FLFEWWSVFW DIFIARTNEK HSEAAAAYIE AQQGKAKEQQ MQIQQLQMMR 101: QAQMQRRDPN HPSLGGPMNA IGSEGMIGQS NASALAAKMY EERMKQPNPM NSETSQPHLD ARMALLKSAT NHHGQIVQGN HQGGVSAALQ QIQSRTQQPT 201: EIKTEVNLGT SPRQLPVDPS TVYGQGILQS KPGMGSAGLN PGVSGLPLKG WPLTGIEQMR PGLGGPQVQK SFLQNQSQFQ LSPQQQQHQM LAQVQAQGNM 301: TNSPMYGGDM DPRRFTGLPR GNLNPKDGQQ NANDGSIGSP MQSSSSKHIS MPPVQQSSSQ QQDHLLSQQS QQNNRKRKGP SSSGPANSTG TGNTVGPSNS 401: QPSTPSTHTP VDGVAIAGNM HHVNSMPKGP MMYGSDGIGG LASSANQLDD MDQFGDVGAL EDNVESFLSQ DDGDGGSLFG TLKRNSSVHT ETSKPFSFNE 501: VSCIRKSASK VICCSFSYDG KLLASAGHDK KVFIWNMETL QVESTPEEHA HIITDVRFRP NSTQLATSSF DKTIKIWDAS DPGYFLRTIS GHAAPVMSID 601: FHPKKTELLC SCDSNNDIRF WDINASCVRA VKGASTQVRF QPRTGQFLAA ASENTVSIFD IENNNKRVNI FKGHSSNVHS VCWSPNGELV ASVSEDAVKL 701: WSLSSGDCIH ELSNSGNKFH SVVFHPSYPD LLVIGGYQAI ELWNTMENKC MTVAGHECVI SALAQSPSTG VVASASHDKS VKIWK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)