AT2G20630.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.763 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PP2C induced by AVRRPM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
PP2C induced by AVRRPM1 (PIA1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein phosphatase 2C family protein (TAIR:AT4G28400.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:8897335..8899648 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31848.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 290 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGREILHKM KVGLCGSDTG RGKTKVWKNI AHGYDFVKGK AGHPMEDYVV SEFKKVDGHD LGLFAIFDGH LGHDVAKYLQ TNLFDNILKE KDFWTDTKNA 101: IRNAYISTDA VILEQSLKLG KGGSTAVTGI LIDGKTLVIA NVGDSRAVMS KNGVASQLSV DHEPSKEQKE IESRGGFVSN IPGDVPRVDG QLAVARAFGD 201: KSLKIHLSSD PDIRDENIDH ETEFILFASD GVWKVMSNQE AVDLIKSIKD PQAAAKELIE EAVSKQSTDD ISCIVPCFLR REALSERYCR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)