AT1G65960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.977 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutamate decarboxylase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
glutamate decarboxylase (GAD2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutamate decarboxylase 2 (GAD2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase (InterPro:IPR002129), Glutamate decarboxylase (InterPro:IPR010107), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutamate decarboxylase (TAIR:AT5G17330.1); Has 2686 Blast hits to 2683 proteins in 834 species: Archae - 189; Bacteria - 1522; Metazoa - 142; Fungi - 352; Plants - 304; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 175 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24555868..24557253 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41754.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 365 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLAGLAFKRK WQNKRKAEGK PYDKPNIVTG ANVQVCWEKF ARYFEVELKE VNLSEGYYVM DPDKAAEMVD ENTICVAAIL GSTLNGEFED VKRLNDLLVK 101: KNEETGWNTP IHVDAASGGF IAPFIYPELE WDFRLPLVKS INVSGHKYGL VYAGIGWVVW RAAEDLPEEL IFHINYLGAD QPTFTLNFSK GSSQIIAQYY 201: QLIRLGFEGY KNVMENCIEN MVVLKEGIEK TERFNIVSKD QGVPVVAFSL KDHSFHNEFE ISEMLRRFGW IVPAYTMPAD AQHITVLRVV IREDFSRTLA 301: ERLVADISKV LHELDTLPSK ISKKMGIEGI AENVKEKKME KEILMEVIVG WRKFVKERKK MNGVC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)