AT5G42760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine carboxyl methyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine carboxyl methyltransferase; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Conserved hypothetical protein CHP00027, methylltransferase (InterPro:IPR011610), Leucine carboxyl methyltransferase (InterPro:IPR007213); Has 1965 Blast hits to 1962 proteins in 270 species: Archae - 38; Bacteria - 1757; Metazoa - 32; Fungi - 3; Plants - 47; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 88 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:17148953..17150105 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39303.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 348 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRETMSEIEK QKPEEEESST TWPDIEEELV LPDVLRSEGV KKLHMSIQSE WDYLQKSACQ TAAGRALWKH VIHDPLAHLF AGETHLRNLH TKIQTDRLNN 101: AREVSGVILA VRTLWFDTRI QAALESFHGD AAQVVLLGAG MDARSYRLNC LNKSDVFEVD FQDVLETKAS LVQAAVNSRD ELRMTAKSLV RVAIDIRDND 201: WFEQLKKSGF LPEINTVWVL EGILYYLSHT EAMQVLNLIA EKCGLTSTVL LADFMNKPSA TLPNSVFHFY SDWPDQLLPT LGFSHVKLSQ IGDPDANFGL 301: LHDPRNLFNK LLRLPRTAQI HPDDGKPCCR LYLVEASGSP PQDNQASL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)