AT5G37510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NADH-ubiquinone dehydrogenase, mitochondrial, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a subunit of the 400 kDa subcomplex of the mitochondrial NADH dehydrogenase (complex I). The protein has been isolated in the male gametophyte. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
embryo defective 1467 (EMB1467); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: response to oxidative stress, photorespiration, embryo development ending in seed dormancy; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial membrane, chloroplast, mitochondrial respiratory chain complex I, respiratory chain complex I; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding (InterPro:IPR019574), NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G (InterPro:IPR010228), Molybdopterin oxidoreductase (InterPro:IPR006656), Ferredoxin (InterPro:IPR001041), NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site (InterPro:IPR000283), NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal (InterPro:IPR015405); Has 12426 Blast hits to 11022 proteins in 2097 species: Archae - 340; Bacteria - 6853; Metazoa - 215; Fungi - 114; Plants - 76; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4828 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:14897490..14900352 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81186.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 745 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLGILASRT IRPASRLLQS QTSNFFLRTI VSKPELQSPE SAAVSEPEPP TQILPPRNPV GGARVHFSNP EDAIEVFVDG YAVKVPKGFT VLQACEVAGV 101: DIPRFCYHSR LSIAGNCRMC LVEVEKSPKP VASCAMPALP GMKIKTDTPI AKKAREGVME FLLMNHPLDC PICDQGGECD LQDQSMAFGS DRGRFTEMKR 201: SVVDKNLGPL VKTVMTRCIQ CTRCVRFASE VAGVQDLGIL GRGSGEEIGT YVEKLMTSEL SGNVIDICPV GALTSKPFAF KARNWELKAT ETIDVSDAVG 301: SNIRVDSRGP EVMRIIPRLN EDINEEWISD KTRFCYDGLK RQRLSDPMIR DSDGRFKAVS WRDALAVVGD IIHQVKPDEI VGVAGQLSDA ESMMVLKDFV 401: NRMGSDNVWC EGTAAGVDAD LRYSYLMNTS ISGLENADLF LLIGTQPRVE AAMVNARICK TVRASNAKVG YVGPPAEFNY DCKHLGTGPD TLKEIAEGRH 501: PFCTALKNAK NPAIIVGAGL FNRTDKNAIL SSVESIAQAN NVVRPDWNGL NFLLQYAAQA AALDLGLIQQ SAKALESAKF VYLMGADDVN VDKIPKDAFV 601: VYQGHHGDKA VYRANVILPA SAFTEKEGTY ENTEGFTQQT VPAVPTVGDA RDDWKIVRAL SEVSGVKLPY NSIEGVRSRI KSVAPNLVHT DEREPAAFGP 701: SLKPECKEAM STTPFQTVVE NFYMTNSITR ASKIMAQCSA VLLKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)