AT5G19010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.922 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitogen-activated protein kinase 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MAP Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mitogen-activated protein kinase 16 (MPK16); FUNCTIONS IN: MAP kinase activity; INVOLVED IN: signal transduction; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 9 (TAIR:AT3G18040.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:6345096..6347676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64915.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 567 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQPDHRKKSS VEVDFFTEYG EGSRYRIEEV IGKGSYGVVC SAYDTHTGEK VAIKKINDIF EHVSDATRIL REIKLLRLLR HPDIVEIKHI LLPPSRREFR 101: DIYVVFELME SDLHQVIKAN DDLTPEHYQF FLYQLLRGLK YIHTANVFHR DLKPKNILAN ADCKLKICDF GLARVAFNDT PTAIFWTDYV ATRWYRAPEL 201: CGSFFSKYTP AIDIWSIGCI FAELLTGKPL FPGKNVVHQL DLMTDMLGTP SAEAIGRVRN EKARRYLSSM RKKKPIPFSH KFPHTDPLAL RLLEKMLSFE 301: PKDRPTAEEA LADVYFKGLA KVEREPSAQP VTKLEFEFER RRITKEDVRE LIYRESLEYH PKMLKEYLDG SEPTNFMYPS AVEHFKKQFA YLEEHYKNGT 401: SHNPPERQQH ASLPRACVLY SDNNHPVAQQ SSAEVTDGLS KCSIRDERPR GADRNAQMPM SRIPINVPQT IQGAAVARPG KVVGSVLRYN NCGAATGVEA 501: LEQQQRRMVR NPAAASQYPK RTQPCKSNRG DEDCATAAEG PSRLKPNTQY IPQKVSAAQD TAMSRWY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)