AT4G32260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATPase, F0 complex, subunit B/B', bacterial/chloroplast | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATPase, F0 complex, subunit B/B', bacterial/chloroplast; FUNCTIONS IN: hydrogen ion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: defense response to bacterium; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, chloroplast, membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F0 complex, subunit B/B', bacterial/chloroplast (InterPro:IPR002146); Has 2587 Blast hits to 2581 proteins in 935 species: Archae - 6; Bacteria - 1820; Metazoa - 10; Fungi - 8; Plants - 73; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 669 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:15573859..15574586 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23919.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 219 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAANSIMASS KPLISLSSNQ QPNRVQIPKF AKLPQIPKSL TSSTDLRSKA LSLSSATAKS LALIAAFAPP SMAEAMEKAQ LFDFNLTLPI IVVEFLFLMF 101: ALDKVYYSPL GNFMDQRDAS IKEKLASVKD TSTEVKELDE QAAAVMRAAR AEIAAALNKM KKETQVEVEE KLAEGRKKVE EELKEALASL ESQKEETIKA 201: LDSQIAALSE DIVKKVLPS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)