AT4G29510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arginine methyltransferase 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Has arginine N-methyltransferase activity. Modifies AtMBD7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arginine methyltransferase 11 (PRMT11); FUNCTIONS IN: protein-arginine N-methyltransferase activity; INVOLVED IN: protein amino acid methylation; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal L11 methyltransferase, PrmA (InterPro:IPR010456); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: protein arginine methyltransferase 1A (TAIR:AT2G19670.1); Has 2778 Blast hits to 2730 proteins in 659 species: Archae - 61; Bacteria - 655; Metazoa - 1180; Fungi - 241; Plants - 326; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 314 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14491739..14493752 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43896.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 390 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTKNSNHDEN EFISFEPNQN TKIRFEDADE DEVAEGSGVA GEETPQDESM FDAGESADTA EVTDDTTSAD YYFDSYSHFG IHEEMLKDVV RTKTYQNVIY 101: QNKFLIKDKI VLDVGAGTGI LSLFCAKAGA AHVYAVECSQ MADMAKEIVK ANGFSDVITV LKGKIEEIEL PTPKVDVIIS EWMGYFLLFE NMLDSVLYAR 201: DKWLVEGGVV LPDKASLHLT AIEDSEYKED KIEFWNSVYG FDMSCIKKKA MMEPLVDTVD QNQIVTDSRL LKTMDISKMS SGDASFTAPF KLVAQRNDYI 301: HALVAYFDVS FTMCHKLLGF STGPKSRATH WKQTVLYLED VLTICEGETI TGTMSVSPNK KNPRDIDIKL SYSLNGQHCK ISRTQHYKMR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)