AT3G28050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.675 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF6, transmembrane (InterPro:IPR000620); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein (TAIR:AT5G40240.1); Has 1917 Blast hits to 1909 proteins in 293 species: Archae - 12; Bacteria - 576; Metazoa - 4; Fungi - 10; Plants - 1200; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 115 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:10442984..10445216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40058.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 367 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARKYFQREV LPVTALVIME CANVGLNTLF KAATLKGMSF HVFIVYSYGL AALLLLPSLF CSFRSRTLPP MNFSILYKIV LLGIIGCCSN IMGYTGINYS 101: SPTLASAISN LTPAFTFLLA VVFRMESVSF KRTSSVAKML GTVVSIGGAF IVTLYNGPVV IAKSPPSVSL RSQSTNPNWI LGAGFLAVEY FCVPLWYIVQ 201: TQIMREYPAE FTVVCFYSIG VSFWTALVTL FTEGNDLGAW KIKPNIALVS IVCSGLFGSC INNTIHTWAL RIKGPLFVAM FKPLSIAIAV AMGVIFLRDS 301: LYIGSLIGAT VITIGFYTVM WGKAKEVALV EDDNKANHEE ANEADLDSPS GSQKAPLLES YKNDEHV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)