AT3G10850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
glyoxalase II cytoplasmic isozyme (Glx2-2) mRNA, complete | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GLY2; FUNCTIONS IN: hydroxyacylglutathione hydrolase activity; INVOLVED IN: methylglyoxal catabolic process to D-lactate; LOCATED IN: endomembrane system, cytoplasm; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-lactamase-like (InterPro:IPR001279), Hydroxyacylglutathione hydrolase (InterPro:IPR017782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glyoxalase 2-4 (TAIR:AT1G06130.2); Has 13211 Blast hits to 13207 proteins in 2289 species: Archae - 256; Bacteria - 8297; Metazoa - 430; Fungi - 311; Plants - 206; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3711 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3397756..3399522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28793.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 258 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKIFHVPCLQ DNYSYLIIDE STGDAAVVDP VDPEKVIASA EKHQAKIKFV LTTHHHWDHA GGNEKIKQLV PDIKVYGGSL DKVKGCTDAV DNGDKLTLGQ 101: DINILALHTP CHTKGHISYY VNGKEGENPA VFTGDTLFVA GCGKFFEGTA EQMYQSLCVT LAALPKPTQV YCGHEYTVKN LEFALTVEPN NGKIQQKLAW 201: ARQQRQADLP TIPSTLEEEL ETNPFMRVDK PEIQEKLGCK SPIDTMREVR NKKDQWRG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)