AT2G47930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arabinogalactan protein 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
arabinogalactan protein 26 (AGP26); Has 1583 Blast hits to 406 proteins in 105 species: Archae - 2; Bacteria - 56; Metazoa - 101; Fungi - 52; Plants - 160; Viruses - 60; Other Eukaryotes - 1152 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19617219..19617629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13983.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 3.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 136 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVSLFTAFT VLSLCLHTST SEFQLSTISA APSFLPEAPS SFSASTPAMS PDTSPLFPTP GSSEMSPSPS ESSIMPTIPS SLSPPNPDAV TPDPLLEVSP 101: VGSPLPASSS VCLVSSQLSS LLLVLLMLLL AFCSFF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)