AT2G17800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Arabidopsis RAC-like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
A member of ROP GTPase family. Rac-like GTP-binding protein ARAC1/ATGP2. Encodes a geranylgeranylated GTP binding protein. Involved in the auxin-activated 26S proteasome-dependent Aux/IAA proteolysis pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Arabidopsis RAC-like 1 (ARAC1); FUNCTIONS IN: GTP binding; INVOLVED IN: auxin mediated signaling pathway, abscisic acid mediated signaling pathway; LOCATED IN: nucleus, cytoplasm, phragmoplast, spindle; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ras GTPase (InterPro:IPR001806), Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), Ras (InterPro:IPR013753), Small GTPase, Rho type (InterPro:IPR003578); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RAC-like 6 (TAIR:AT4G35950.1); Has 24212 Blast hits to 24183 proteins in 668 species: Archae - 9; Bacteria - 59; Metazoa - 12648; Fungi - 3488; Plants - 2694; Viruses - 20; Other Eukaryotes - 5294 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:7740313..7741942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21531.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 197 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSASRFIKCV TVGDGAVGKT CLLISYTSNT FPTDYVPTVF DNFSANVVVN GATVNLGLWD TAGQEDYNRL RPLSYRGADV FILAFSLISK ASYENVSKKW 101: IPELKHYAPG VPIVLVGTKL DLRDDKQFFI DHPGAVPITT AQGEELKKLI GAPAYIECSS KTQENVKGVF DAAIRVVLQP PKQKKKKSKA QKACSIL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)