AT5G64860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : disproportionating enzyme | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a maltotriose-metabolizing enzyme with chloroplastic α-1,4-glucanotransferase activity. Mutant has altered starch degradation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
disproportionating enzyme (DPE1); FUNCTIONS IN: 4-alpha-glucanotransferase activity, cation binding, catalytic activity; INVOLVED IN: response to cold, starch catabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycoside hydrolase, family 77 (InterPro:IPR003385), Glycoside hydrolase, catalytic core (InterPro:IPR017853), Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core (InterPro:IPR013781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: disproportionating enzyme 2 (TAIR:AT2G40840.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25925373..25928788 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64415.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 576 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSILLRPSSS PSLCSSLKLF RLSSPDSLID AAVLRNRTKP SQSFRMEVVS SNSTCLSSIS VGEDFPSEYE QWLPVPDPES RRRAGVLLHP TSFRGPHGIG 101: DLGEEAFRFI DWLHSTGCSV WQVLPLVPPD EGGSPYAGQD ANCGNTLLIS LDELVKDGLL IKDELPQPID ADSVNYQTAN KLKSPLITKA AKRLIDGNGE 201: LKSKLLDFRN DPSISCWLED AAYFAAIDNT LNAYSWFEWP EPLKNRHLSA LEAIYESQKE FIDLFIAKQF LFQRQWQKVR EYARRQGVDI MGDMPIYVGY 301: HSADVWANKK HFLLNKKGFP LLVSGVPPDL FSETGQLWGS PLYDWKAMES DQYSWWVNRI RRAQDLYDEC RIDHFRGFAG FWAVPSEAKV AMVGRWKVGP 401: GKSLFDAISK GVGKIKIIAE DLGVITKDVV ELRKSIGAPG MAVLQFAFGG GADNPHLPHN HEVNQVVYSG THDNDTIRGW WDTLDQEEKS KAMKYLSIAG 501: EDDISWSVIQ AAFSSTAQTA IIPMQDILGL GSSARMNTPA TEVGNWGWRI PSSTSFDNLE TESDRLRDLL SLYGRL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)