AT3G52180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dual specificity protein phosphatase (DsPTP1) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plant-specific protein phosphatase that contains a protein tyrosine phosphatase (PTP) catalytic domain and a kinase interaction sequence (KIS) domain. This protein interacts with the plant SnRK AKIN11. Binds starch. Localized in the chloroplast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
STARCH-EXCESS 4 (SEX4); FUNCTIONS IN: protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity, polysaccharide binding; INVOLVED IN: protein amino acid dephosphorylation, starch metabolic process, starch catabolic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dual-specific/protein-tyrosine phosphatase, conserved region (InterPro:IPR000387), Dual specificity phosphatase, catalytic domain (InterPro:IPR000340); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: dual specificity protein phosphatase (DsPTP1) family protein (TAIR:AT3G10940.1); Has 675 Blast hits to 675 proteins in 103 species: Archae - 6; Bacteria - 6; Metazoa - 399; Fungi - 10; Plants - 178; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 73 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19349884..19353459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42628.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 379 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNCLQNLPRC SVSPLLGFGC IQRDHSSSSS SLKMLISPPI KANDPKSRLV LHAVSESKSS SEMSGVAKDE EKSDEYSQDM TQAMGAVLTY RHELGMNYNF 101: IRPDLIVGSC LQTPEDVDKL RKIGVKTIFC LQQDPDLEYF GVDISSIQAY AKKYSDIQHI RCEIRDFDAF DLRMRLPAVV GTLYKAVKRN GGVTYVHCTA 201: GMGRAPAVAL TYMFWVQGYK LMEAHKLLMS KRSCFPKLDA IRNATIDILT GLKRKTVTLT LKDKGFSRVE ISGLDIGWGQ RIPLTLDKGT GFWILKRELP 301: EGQFEYKYII DGEWTHNEAE PFIGPNKDGH TNNYAKVVDD PTSVDGTTRE RLSSEDPELL EEERSKLIQF LETCSEAEV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)