AT5G61840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Exostosin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GUT1; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Exostosin-like (InterPro:IPR004263); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Exostosin family protein (TAIR:AT1G27440.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24839365..24841703 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47197.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 415 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLSSCVLIF LLCNTFSSIS AFRLSRSQPT ERISGSAGDV LEDDPVGRLK VFVYELPSKY NKKILQKDPR CLNHMFAAEI YMQRFLLSSP VRTLNPEEAD 101: WFYVPVYTTC DLTPNGLPLP FKSPRMMRSA IQLIASNWPY WNRTEGADHF FVVPHDFGAC FHYQEEKAIG RGILPLLQRA TLVQTFGQRN HVCLKEGSIT 201: VPPYAPPQKM QSHLIPEKTP RSIFVYFRGL FYDVGNDPEG GYYARGARAA VWENFKDNPL FDISTEHPTT YYEDMQRAIF CLCPLGWAPW SPRLVEAVIF 301: GCIPVIIADD IVLPFADAIP WEDIGVFVDE KDVPYLDTIL TSIPPEVILR KQRLLANPSM KQAMLFPQPA QPGDAFHQVL NGLARKLPHE RSVYLRPGEK 401: LLNWTAGPVA DLKPW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)