AT5G58800.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Quinone reductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
Quinone reductase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, FMN binding; INVOLVED IN: negative regulation of transcription; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavoprotein WrbA (InterPro:IPR010089), NADPH-dependent FMN reductase (InterPro:IPR005025), Flavodoxin/nitric oxide synthase (InterPro:IPR008254); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Quinone reductase family protein (TAIR:AT4G27270.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23746032..23746895 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 22724.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 207 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVTKIYIVY YSLHGHVETM AREVLRGVNS VPDVEATLWQ VPETLPEKIL EKVKAVPRPD DVPDIRPEQL AEADGFMFGF PSRFGVMASQ VMTFFDNTND 101: LWTTQALAGK PAGIFWSTGF HGGGQELTAL TAVTKLAHHG MIFVPVGYTF GKSMYEMGEV KGGSPYGSGT YAADGSREPT ELEIQQANYH GKYFAGIAKK 201: LKKRSPV |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)