AT5G47760.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 0.992 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : 2-phosphoglycolate phosphatase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
serine/threonine protein kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
2-phosphoglycolate phosphatase 2 (PGLP2); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, phosphoglycolate phosphatase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA (InterPro:IPR006357), 2-phosphoglycolate phosphatase, eukaryotic (InterPro:IPR006349); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 2-phosphoglycolate phosphatase 1 (TAIR:AT5G36700.4); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr5:-:19343121..19344979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 33013.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 4.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 301 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPQLLSSSN FKSLFDSVDT FLFDCDGVIW KGETLIDGVS QTLDLIRSKG KNVVFVTNNS VKSRRQYAEK FRSLGVTSIT QDEIFSSSFA AAMYLKVNNF 101: PKDKKVYVIG GEGVLEELQI AGFTGLGGPE DGEKKAQWKS NSLFEHDKSV GAVVVGLDPN INYYKLQYGT LCVRENPGCL FIATNRDAVG HMTDLQEWPG 201: AGCMVAAMCG STEREPIVVG KPSTFMMDFL LQKFGTETSR MCMVGDRLDT DILFGQNAGC KTLLVLTGVT SESNLLDKGN KIEPDYYTST VSDIIKLMES 301: P |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)