AT5G37300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.814 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : O-acyltransferase (WSD1-like) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a bifunctional enzyme, wax ester synthase (WS) and diacylglycerol acyltransferase (DGAT). In vitro assay indicated a ratio of 10.9 between its WS and DGAT activities. Both mutant and in vivo expression/analysis in yeast studies indicated a role in wax biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WSD1; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: O-acyltransferase, WSD1, C-terminal (InterPro:IPR009721), O-acyltransferase, WSD1, N-terminal (InterPro:IPR004255); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: O-acyltransferase (WSD1-like) family protein (TAIR:AT2G38995.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:14767514..14770058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54420.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 481 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKAEKVMERE IETTPIEPLS PMSHMLSSPN FFIVITFGFK TRCNRSAFVD GINNTLINAP RFSSKMEINY KKKGEPVWIP VKLRVDDHII VPDLEYSNIQ 101: NPDQFVEDYT SNIANIPMDM SKPLWEFHLL NMKTSKAESL AIVKIHHSIG DGMSLMSLLL ACSRKISDPD ALVSNTTATK KPADSMAWWL FVGFWFMIRV 201: TFTTIVEFSK LMLTVCFLED TKNPLMGNPS DGFQSWKVVH RIISFEDVKL IKDTMNMKVN DVLLGMTQAG LSRYLSSKYD GSTAEKKKIL EKLRVRGAVA 301: INLRPATKIE DLADMMAKGS KCRWGNFIGT VIFPLWVKSE KDPLEYIRRA KATMDRKKIS LEAFFFYGII KFTLKFFGGK AVEAFGKRIF GHTSLAFSNV 401: KGPDEEISFF HHPISYIAGS ALVGAQALNI HFISYVDKIV INLAVDTTTI QDPNRLCDDM VEALEIIKSA TQGEIFHKTE V |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)