AT5G24290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Vacuolar iron transporter (VIT) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Vacuolar iron transporter (VIT) family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF125, transmembrane (InterPro:IPR008217); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vacuolar iron transporter (VIT) family protein (TAIR:AT4G27860.1); Has 11871 Blast hits to 4498 proteins in 431 species: Archae - 22; Bacteria - 6501; Metazoa - 1569; Fungi - 486; Plants - 257; Viruses - 63; Other Eukaryotes - 2973 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:8263271..8265618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61049.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 550 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKSNQPVHV TLSELKDGDK EIVDAEFLVD LLESYRFGKD NVPAREFRSK AAATAPAPVN TTEIELEEDN DGSQAQGNNS VSESTSSLFS DSDPIVLEST 101: VSETGSNEES ETGSNEENGN NWLESSSTNL PNVENKRQRN GEDCEIEEEE ENNERSLSDS EEKSNLEKLL GTQENYELGN EDEEKNERSS SDSEEKSNLE 201: NLLATQENYE LYCPSCSTCI TRNVVLKKRK RGKHVNSSLD LKPDIPVVEP DEPSDIEEME SPVKVYVPET RIEDDQEDKE GTIFTCLVCD LKYFIRLGTK 301: FLQLDYIRGK PVEKSVEEYI DVRKSINTTQ SPPQIQPDGE RFAIELLKST VYGGLTETIT SLGVVSSASA SGSSTMNILA LAVANLAGGL IVLAQNFQDL 401: RNSSDQEKDR YEELLGRRTK SRIHILVAVM SYIFFGLIPP LVYAFSFYET GIKNYKLISV FLGSLVCVIL LGSIKVYVRK PTNSCGSTKA YLKSAAYYTS 501: IVVASCGISY VVGDIMGEYI EKLSLVGLDQ ISITSPCYGI KPEECRFTSF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)