AT5G23270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sugar transporter 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
sugar transporter 11 (STP11); FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sugar transporter 9 (TAIR:AT1G50310.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7839132..7840874 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56727.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 514 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGGAFIDES GHGGDYEGRV TAFVMITCIV AAMGGLLFGY DIGISGGVIS MEDFLTKFFP DVLRQMQNKR GRETEYCKYD NELLTLFTSS LYLAALFASF 101: LASTITRLFG RKVSMVIGSL AFLSGALLNG LAINLEMLII GRLFLGVGVG FANQSVPLYL SEMAPAKIRG ALNIGFQLAI TIGILAANIV NYVTPKLQNG 201: IGWRLSLGLA GVPAVMMLVG CFFLPDTPNS ILERGNKEKA KEMLQKIRGT MEVEHEFNEL CNACEAAKKV KHPWTNIMQA RYRPQLTFCT FIPFFQQLTG 301: INVIMFYAPV LFKTIGFGND ASLISAVITG LVNVLSTIVS IYSVDKFGRR ALFLQGGFQM IVTQIAVGSM IGWKFGFNGE GNLSGVDADI ILALICLYVA 401: GFAWSWGPLG WLVPSEICPL EIRSAGQSLN VSVNMFFTFF IGQFFLTMLC HMKFGLFYFF AGMVLIMTIF IYFLLPETKG VPIEEMGKVW KEHRYWGKYS 501: NNDDGDDVDD DAYF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)